酷熱和菲律賓的放蕩生活是一種挑戰。麥克阿瑟一貫對女人興趣很濃，當然會受到他遇到的一些菲律賓女郎的極大引誘。他稱她們為「『像菲律賓月光一樣細膩』的可愛女郎」，要拒絕她們太難了戶與她們約會的白人軍官都冒著前途被毀的危險。不可避免的是某些人甘冒風險。據說當時流傳著一首調情的小調：「玫瑰花啊紅又紅，紫羅蘭啊充滿情，敢問先生你喜歡哪一種？」

不過，我們可以相當肯定地說，「粉姬」和將軍在律己方面給了他們的孩子們嚴格的教育，這種教育又在主教和西得克薩斯軍事學院得到了最好的強化。麥克阿瑟抵禦月光般細膩誘惑的武器是一面穿衣鏡。他買下這面鏡子後，把它安裝在自己的宿舍裡。當情欲洶湧，本性就要壓倒教養時，他便站在鏡子前，給鏡子裡年輕的麥克阿瑟少尉一頓狠訓，就像在西點軍校一名憤怒的戰術軍官對待有些屢教不改的刺兒頭學員一樣。

開始的幾個月，麥克阿瑟少尉負責在南部島嶼進行的建築項目。例如，他監督塔克羅班的碼頭建設，1944年10月20日，他將在那兒附近再次踏上菲律賓。第二次世界大戰期間令他最激動的事情之一就是40年後看到那些碼頭仍然挺立在那裡，像老朋友一祥等著他回來。

1903年11月，他在吉馬里斯島工作時曾遭到兩名起義者的伏擊。其中一人用步槍向地射擊，子彈從麥克阿瑟頭上的軍帽頂部穿過。他還沒來及打第二槍，麥克阿瑟就拔出左輪手槍將他們兩人都擊斃了。工地的工頭是一名陸軍軍士，他衝到現場，看了看兩具屍體，又瞟了一眼麥克阿瑟帽子上的洞，敬了個禮並用濃重的愛爾蘭口音說：「請少尉原諒，不過您今後將一生平安！」麥克阿瑟很喜歡講這個故事，幾乎對他認識的每個人講。其真實程度不得而知。但麥克阿瑟不太可能杜撰一道彈痕，因此可以相信有人曾向麥克阿瑟開槍但未打中，在這種情況下他幾乎肯定會還擊。至於他是否真的擊斃了什麼人就值得懷疑了。

1904年春天，麥克阿瑟經考核提升為中尉。考核委員會的高級軍官，一名上校，提了一個問題讓他解決：當港口受到海陸襲擊時他如何防禦？麥克阿瑟解釋了他將如何部署部隊。然後上校把他的兵力減少到幾乎為零，問現在他該怎麼辦？

「兩件事，」麥克阿瑟回答說，「首先，我將召集附近所有的油漆工，讓他們寫上『小心，港口有水雷』。然後我把這些標誌放漂出港口。完了我就跪下來祈禱。最後我便衝出去殺他個天昏地暗。」
升為中尉後，麥克阿瑟被任命為馬尼拉工程總指揮助理。他雖然看上去很忙，但他的心多半仍不在工兵部隊。他擠時間寫了一本偵察手冊供菲律賓警察部隊用，這是一支由塔夫脫創建的准軍事警察部隊。這支隊伍由菲律賓人組成，美國軍官指揮，它的口號是：「人少，一貫如此——打敗我們，做夢。」o警察部隊指揮詹姆斯‧G‧哈伯德（James G Harbord）上尉非常滿意安克阿瑟所做的貢獻，他請年輕的作者到馬尼拉的陸海軍俱樂部吃了一頓飯。

這座白色的3層樓是馬尼拉最富麗堂皇的建築之一。它面對馬尼拉灣迷人的風景，佔地3英畝，遍佈鳳凰木、氣派的棕桐樹和九重葛，九重葛絢麗的熱帶花朵像噴泉流出的大瀑布，覆蓋著大片的草地嚴哈伯德清麥克阿瑟吃飯的當晚，他給中尉介紹了兩位年輕的菲律賓律師，馬努爾‧奎松和舍喬‧奧斯門納。奎松曾是阿奎納多的助手，但阿奎納多被方斯頓俘虜後，奎松就放棄了起義的目標嚴與奧斯門紛一樣，他進了法律學校，準備走上政壇，為祖國的獨立奮鬥終身。奎松和奧斯門紛注定將成為麥克阿瑟生活中的重要人物，」而麥克阿瑟也將成為他們一生中的重要人物。

駐菲律賓美軍的主要威脅不再來自於摩洛人或起義者，而來自瘧疾。上島後一年，麥克阿瑟因瘧疾發燒而出汗、顫抖。使他更痛苦的是，他還忍受著另一種熱帶病的折磨：癬菌病。1904年10月，他被送回家養病。返美途中，他在「托馬斯號」（Thomas）運輸艦上和他的同窗好友比爾‧羅斯同住一室。

工程總指揮在報告中對麥克阿瑟在菲律賓一年的優異成績讚美有加。麥克阿瑟回國後被分到舊金山的地區工程兵辦公室工作。瘧疾繼續損害著他的健康，他的視力也困擾著他。他的身體長期都很虛弱，他的上級給他的任務相對較輕。在舊金山的頭一年裡，他推一感興趣的任務是在加利福尼亞尾礦委員會幾個月的工作。這個委員會負責清理內華達山腳沙礦開採時留下的環境垃圾。

麥克阿瑟在炙熱的藍天下騎馬查看了礦區，呼吸著山區醉人的空氣。這是任何醫生都開不出的最佳良藥。松林覆蓋的山坡，幾近空曠的金城，水光鱗鱗的溪流，鷹擊長空的呼嘯，舊時西部的生活再現眼前。對兒時在前線田園詩歌般回憶的難捨舊情使麥克阿瑟恢復了健康和活力。

1903年12月，亞瑟‧麥克阿瑟將軍在視察途中訪問了夏威夷。這本來是一次日常活動，但他無意中對兩名國民衛隊軍官談論了德意志帝國的野心問題。將軍對大批德國人移民南美感到擔憂，他們在那裡介入政治，德國不久就能向門羅主義挑戰了。德國人還對太平洋懷有野心。他並沒有說得很明白，他也不必說得明白。對政治敏感的人都清楚，美國吞併夏威夷和佔領菲律賓的一個重要原因就是預防德國人插足。總之，亞瑟‧麥克阿瑟認為德美之戰不可避免。其中一位國民衛隊軍官把這些話透露給了一名記者，它們被迅速從夏威夷傳到了本土。

真正激起極大。憤怒的是亞瑟‧麥克阿瑟對德美容城關係的中傷。德美聯合會憤怒地向白宮和陸軍部抗議。羅斯福批評了亞瑟‧麥克阿瑟。1904年3月，塔夫脫出任陸軍部長後所做的第一件事就是要求亞瑟‧麥克阿瑟解釋他究竟說了些什麼。

由於1904年2月開始的日俄戰爭迅速升級，這場騷亂很快就過去了。野心勃勃的日本擴張主義者把俄國拖進了戰爭，並因此控制了朝鮮。日本人駛入朝鮮灣，一個集團軍的兵力在中國的遼寧省登陸，一路向南殺向俄國在這一地區的主要軍事基地旅順港，並將之團團包圍。

作為一股強大潛在力量突然崛起的日本不可忽視。1904年12月，一貫對遠東感興趣的亞瑟‧麥克阿瑟請求去當觀察員。他說他希望能目睹至少一次主要戰鬥，以研究日軍集團軍的野戰組織廣他的請求得到了允許，但此時旅順港已瀕於投降。

他被任命為美國駐東京大使的臨時武官。常住武官非潘興上校莫屬產麥克阿瑟夫婦和潘興一家一道前往東京。就在這個時候，亞瑟‧麥克阿瑟的兒子道格拉斯也請求被任命為戰時觀察員，但因軍階太低、資歷過淺而遭到拒絕。